学校现有1个国家级人文社科重点研究基地(国家革命文物协同研究中心),1个国家工程技术研究中心(国家单糖化学合成工程技术研究中心),1个国家地方联合工程实验室(分子筛膜材料国家地方联合工程实验室),1个国家淡水鱼加工技术研发专业中心,1个国家大学科技园,2个国际科技合作基地(无机膜材料国家国际科技合作基地、网络化支撑软件国家国际科技合作基地),2个教育部重点实验室(鄱阳湖湿地与流域教育部重点实验室、氟硅能源材料与化学教育部重点实验室),1个国家体育总局重点实验室(水上项目训练监控与干预重点实验室),1个教育部国别和区域研究中心(马达加斯加研究中心),1个外交部国别和区域研究中心(中日韩合作研究中心),1个全国高校辅导员发展研究中心,1个国家级科技服务平台(高校学生科技创业实习基地),6个省“2011协同创新中心”,3个省高校高水平创新平台立项建设项目(1个实验室和2个工程研究中心),1个省应用数学中心,12个省级重点实验室,4个省级工程技术研究中心,3个江西省产学研合作示范培育基地,4个省工程实验室,7个省社联哲学社会科学重点研究基地,2个省级高端智库,8个省教育厅人文社科重点研究基地,1个省级管理科学研究基地,2个省文化厅文化艺术科学重点研究基地,1个省级软科学研究基地。
学校聚焦重大科研创新,优化组织模式,加强团队建设和梯队培养,不断提升创新能力。近5年来,获国家自然科学基金363项,其中重点4项。获国家社会科学基金178项,年度项目立项数位居全国高校50强,连续6年居全省第1位。学校共办有学术期刊5本,其中《星空·体育(中国)官方网站学报(自然科学版)》《星空·体育(中国)官方网站学报(哲学社会科学版)》《心理学探新》等3本刊物为“全国中文核心期刊”,《星空·体育(中国)官方网站学报(哲学社会科学版)》为CSSCI来源期刊,国际期刊《计算城市科学》(Computational Urban Science)被国际核心数据库EI收录。